Esta breve lista lo ayudará a empezar:

Entidades Financieras

Banco Nacional de Costa Rica (BNCR):
https://www.bncr.fi.cr/portalmipyme/
“BN Desarrollo ofrece servicios financieros adaptados a las necesidades de las empresarias y los empresarios que buscan obtener mayores logros y hacer su esfuerzo cada día más rentable.”

Banco Popular y de Desarrollo Comunal (BP)
https://www.popularenlinea.fi.cr/Bpop/Menu/Corporativo/PopDesarrollo/

Banco de Costa Rica BCR
http://www.bancobcr.com/bcr.php?id=48

Banco Central de Costa Rica Cambio de dólar, Banda Cambiaria, Contratación Administrativa
http://www.bccr.fi.cr/flat/bccr_flat.htm

Asociación Costarricense para Organizaciones de Desarrollo (ACORDE)
http://www.acorde.or.cr

Fundación Costa Rica-Canadá
http://www.fundacioncostaricacanada.org
Crédito para Pequeña Empresa

Instituto Mixto de Ayuda Social  ( IMAS )
Financiamiento de Emprendimientos productivos
http://www.imas.go.cr/prog_soc/beneficios_ind/bi_emprend_prod_indiv.html

Educación

Instituto Nacional de Aprendizaje (INA)
http://infoweb.ina.ac.cr/cursos/

Intermediación de Empleo (INA)
http://www.buscoempleocr.com

Instituto Tecnológico de Costa Rica (ITCR)
http://www.cietec.org/

Fundación para el Desarrollo Sostenible de la Pequeña y Mediana Empresa (FUNDES)

http://www.fundes.org/costarica

Este sitio Web le proporciona información sobre Servicios de Desarrollo Empresarial: Formación Empresarial, Consultoría y Estudios Especiales.

Universidad Estatal a Distancia (Observatorio de MIPYMES)

http://www.uned.ac.cr/omipymes/

La Universidad Estatal a Distancia es la primera en su género en Costa Rica, con un sistema de enseñanza cuya principal característica es llevar el conocimiento a todo el país sin que importen el lugar y la distancia. El Observatorio de MIPYMES genera información y conocimiento, oportuno y continuo, para el fortalecimiento de la competitividad sostenible de las MIPYMES de Costa Rica.

Ministerios

Ministerio de Economía Industria y Comercio
http://www.pyme.go.cr/svs/herramientas/
En esta página podrá hacer negocios en línea, encontrara herramientas e insumos de apoyo a sus actividades productivas y comerciales

Ministerio de Ciencia y tecnología (MICIT)
http://www.micit.go.cr/programas
Objetivo financiar las acciones y actividades dirigidas a promover y mejorar la capacidad de gestión y competitividad de la PYME costarricenses, mediante el desarrollo tecnológico y científico

Ministerio de Trabajo y Seguridad Social:
http://http://www.ministrabajo.go.cr/informacion%20laboral/Menu.htm
Este sitio tiene información general sobre temas laborales, jornada laborales, preaviso, cesantía, aguinaldos,  contratos de trabajo otros.

Ministerio de Agricultura y Ganadería:
http://http://www.mag.go.cr/

Ministerio de Salud
http://http://www.ministeriodesalud.go.cr/index.php/inicio-menu-principal-ministerio-virtual-ms/registro-alimentos-materias-primas-ms/
Requisitos para la Inscripción de regsitros de Alimentos.

Caja Costarricense Seguro Social
http://admsjoapp20.ccss.sa.cr/index.jsp?step=1&substep=4
Puedes realizar las planillas en línea sin tener que desplazarse a las sucursales de la CCSS

Otras entidades de Capacitación

CEGESTI
http://www.cegesti.org/servicios/servicios.htm
Capacitación en Gestión de Calidad, Gestión de Ambiental

Centro de Formación de Formadores (CEFOF)
http://www.cefof.ac.cr/
Centro Regional de la Productividad te ayuda a incrementar la productividad de la Pequeña y Mediana empresa en la Región Centro Americana a través del mejoramiento del Recurso Humano.

Desarrollo Proyectos Tecnológicos

Consejo Nacional para la Investigación Científica y Tecnológica (CONICIT)
http://www.conicit.go.cr/
Si tienes un proyecto de desarrollo tecnológico puedes optar en este sitio por un financiamiento.

Sistema de Información Regional  de la Zona Norte SIRZEE
http://www.sirzee.itcr.ac.cr/
En este sitio se encuentra información  que favorecer los procesos productivos de pequeños y medianos productores de la Región Huetar Norte